所谓的第二阶段通常指游戏进程中的一个关键分水岭，即进入困难模式。这并非一个通过简单菜单选项切换的阶段，而是需要玩家通过一系列挑战和准备才能触发的世界性转变。这一转变会显著提升游戏难度，解锁新的生物群落、敌人、矿石和更强大的装备，是整个冒险旅程的一次全面升级。你的目标就是为这个转变做好充足准备，并最终触发它。
进入第二阶段（困难模式）的核心前提是击败位于世界最底层的强大Boss血肉墙（又称肉山）。在挑战它之前，你需要先经历一个扎实的开荒发育期。从最初用斧头、镐子收集木材和矿石开始，逐步升级你的装备，至少要收集到金装或同级别的装备，并熟练掌握基础战斗、走位和药水制作。探索地下，挖掘并加工出便于行动和战斗的矿道空间至关重要。你需要为NPC搭建合格的住所，并确保自己拥有了足以应对高强度战斗的武器和饰品。
当你感觉装备和实力足够时，就可以着手召唤肉山。你需要前往地狱场景，并确保有一条足够长且平整的平台道路，以便在战斗中能够一边后退一边持续输出。召唤肉山需要使用向导巫毒娃娃作为祭品，将其扔进地狱的岩浆中即可召唤。击败这个强大的敌人后，游戏世界会立即发生剧变，你的世界将正式进入困难模式，也就是通常所说的第二阶段。
进入困难模式后，世界会生成全新的神圣与腐化/猩红之地，并出现更高级的矿物。这标志着你进入了游戏的中后期。一部分事件和挑战的第二阶段才会解锁。撒旦军团事件的第二阶段，就需要你在困难模式中击败任意一个机械Boss后，才能通过激活永恒水晶来触发。而像光之女皇这样的Boss，其战斗本身也分为两个阶段，当她的血量降低到一定程度时就会变身进入更具威胁的第二阶段。
